一般社団法人 日本ロジスティクスシステム学会は会長、副会長、理事並びに監事より構成され、最高決定機関である理事会の下に運営されている。

【主要役員】
名誉会長:唐澤豊(神奈川大学)
 会長 :若林敬造(日本大学)
 副会長:石原良晃(大島商船高等専門学校)
 副会長:佐藤勝尚(豊橋創造大学)
 副会長:宿元明(別府大学)
 副会長:高桑宗右ヱ門(中央大学)
 副会長:藤本隆宏(東京大学)
 顧問 :平木秀作(広島大学名誉教授)
 顧問 :北岡正敏(神奈川大学)

【設置委員会及び委員長】
 研究委員会 :薫彦文(福島大学)
 編集委員会 :石原良晃(大島商船高等専門学校)
産学交流委員会:鈴木邦成(日本大学)
 会員委員会 :鈴木邦成(日本大学)
 財務委員会 :中村塁(鈴与㈱)
 表彰委員会 :渡邊昭廣(日本大学)
 国際交流委員:竹野健夫(岩手県立大学)
学生助成委員会:中村塁(鈴与㈱)
 総務委員会 :深野宏之(深野技術士事務所)